20 maja 1945r. ppłk Topór przekazał otrzymane od płk. Rzepeckiego polecenie likwidacji struktur organizacji NIE we Lwowie.
Druga, główny fala okres opuszczania Kresów południowo-wschodnich przez żołnierzy AK trwał od sierpnia do grudnia 1945r. w trakcie której wywożono archiwa konspiracyjne oraz broń.
Każdy transport wyjeżdżający ze Lwowa był sprawdzany przez sowieckie służby. Ewakuowani żołnierze lwowskiej AK wraz z rodzinami transportami udali się na;
- Dolny Śląsk zamieszkując w powiatach jeleniogórskim, legnickim, lubańskim, zgorzeleckim, głogowskim
- w Zielonogórskie w powiatach żagańskim, żarskim, kożuchowskim, szprotawskim
tworząc/odtwarzając Eksterytorialny Okręg Lwów AK - WiN.
Oficerowie pierwszej fali byli przekonani o czasowej sytuacji i szybkim powrocie do domu do Lwowa, natomiast oficerowie drugiej fali nie mieli już wątpliwości co do ich wyjazdu z Kresów.
Przerzucenie żołnierzy AK odbyło się bez większych strat. Szczególny wkład podczas ewakuacji wniosła komórka legalizacyjna Komendy Okręgu Lwów pod kierownictwem artysty plastyka Jana Brodzisza ps Ścibora, pracownicy z instytucji zajmujących się ewakuacją ludności polskiej.
W październiku 1945r. transportem kolejowym opuścił Lwów udając się do Krakowa płk Jan Władyka ps. Rajgras, Janina (27 sierpnia 1896 - 2 listopad 1967, Komendant Obszaru Lwowskiego NIE), który z mjr Anatolem Sawickim Komendantem Okręgu Lwów, mjr Marianem Jędrzejewskim Komendantem Garnizonu lwowskiego i kpt. Bronisławem Żeglinem Komendantem Okręgu Tarnopol. Jednakże jeszcze do połowy 1946r. działała we Lwowie komórka Propagandy Narodowej Organizacji Wojskowej wydająca konspiracyjne pismo Słowo Polskie.
W lipcu 1945r. zostało zdemobilizowane i ewakuowane z Rzeszowszczyzny liczące ok. 1500 żołnierzy w dużej liczbie na Dolny Śląsk min. w jeleniogórskie, lubańskie, zgorzeleckie Zgrupowanie Lwowskie Oddziałów Leśnych Warta AK, którym dowodził płk. Franciszek Rekucki (6 czerwca 1895 - 20 marca 1972, Komendant Obwodu Kraków Miasto AK, Z-ca Komendant Okręgu Lwów AK, D-ca Zgrupowania Leśnych Oddziałów Lwowskich Warta, Prezes Okręgu Jelenia Góra Zachód WiN) i jego z-ca płk. Bolesłąw Tomaszewski.
W wyniku sowieckich aresztowań straty organizacji NIE we Lwowie i na podległym obszarze wynosiły ok. 33% stanów.W pierwszych miesiącach 1946r. oficerom ze lwowskiego i tarnopolskiego płk. Jana Władyki udało się na terenie południowo-zachodniej Polski zbudować szkielet struktury siatek okręgowych, w tym zorganizować łączność, komórki informacyjne, legalizacji oraz zabezpieczyć broń. Przeszkodami dla sprawnego funkcjonowania eksterytorialnych struktur było duże rozrzucenie żołnierzy podziemia na terenie
południowo-zachodniej Polski, zmęczenie życiem w konspiracji wielu, świadomość tymczasowości na przyłączonych ziemiach, obawa o losy najbliższych za Sanem, powszechne oczekiwanie na III wojnę. Liczono, że w wyniku konfliktu zbrojnego Polska uwolni się od narzuconego komunistycznego reżimu i odzyska Kresy Wschodnie.
W południowo-zachodniej Polsce począwszy od Krakowa, przez Górny i Dolny Śląska na tereny obecnego Lubuskiego w oparciu o ewakuowane kadry oficerskie i żołnierzy Obszaru Lwowskiego AK - NIE powstały nowe trzy konspiracyjne struktury kresowe:
– Okręg Jelenia Góra Zachód WiN pod kierownictwem byłego dowódcy Zgrupowania Leśnych Oddziałów Lwowskich Warta AK płk. Franciszkiem Rekuckim i jego zastępcy ppłk. Bolesława Tomaszewskiego ps. Zamojski, który z październiku 1944r. przejął kierownictwo Okręgu. Płk Rekucki po rezygnacji z czynnej konspiracji przeszedł do Pułku Zapasowego I Brygady Kadrowej 5 Dywizji Lwowskiej Eksterytorialnego Okręgu Lwów AK. Okręg zorganizowany po rozwiązaniu w lipcu 1945r. i ewakuacji z Rzeszowszczyzny na Dolny Śląsk żołnierzy Zgrupowania Lwowskich Oddziałów Leśnych Warta, został podporządkowany Zarządowi Obszaru Południowego WiN w Krakowie, którym kierował mjr. Łukaszowi Cieplińskiemu ps. Ostrowski. Okręg został rozbity przez sowiecką agenturę UB w czerwcu 1946r. Siedziba Okręgu była umiejscowiona w Jeleniej Górze.
– Eksterytorialny Okręg Tarnopol AK - WiN kryptonim Karkonosze organizowali mjr. Franciszek Garwol (6 sierpnia 1904 - 21 marca 1982, ostatni Komendant Okręgu Tarnopol AK) i por. Zygfryd Szynalski od września - października 1945r. na Dolnym i Górnym Śląsku oraz Zielonogórskim, w miejscowościach gdzie osiedliła się tarnopolska ludność. Po powołaniu pod koniec 1945r. mjr. Franciszka Garwola przez mjr. Anatola Sawickiego na Szefa Sztabu I Brygady Kadrowej 5 Dywizji Lwowskiej Eksterytorialnego Okręgu Lwów WiN kierownictwo Okręgu przejął kpt. Bronisław Żeglin ps. Ordon ostatni Komendant Okręgu Tarnopol NIE. 29 marca 1946r. kpt. Bronisława Żeglina ps. Ordon zgodnie z wcześniejszymi zaleceniami poinformował podległych żołnierzy o nowym kryptonimie organizacyjnym WiN. Okręg podporządkowany ewakuowanej Komendzie Obszaru Lwowskiego AK - NIE został rozbity masowymi aresztowaniami przez sowiecką agenturę UB w okresie od listopada 1946r.do stycznia 1947r. Mjr. Bronisław Żeglin zawiesił działalność konspiracyjną i wyjechał do Elbląga przekazując swoje uprawnienia zastępcy por. Zygfrydowi Szynalskiemu. Mjr. Żeglin cały czas utrzymywał kontakt z mjr. Franciszkiem Garwolem Szefem Sztabu I Brygady Kadrowej 5 Dywizji Lwowskiej Eksterytorialnego Okręgu Lwów WiN.
– Eksterytorialny Okręg Lwów AK - WiN ppłk. Anatola Sawickiego ps. Cybulski utworzony na przełomie 1945 i 1946r. po przyjeździe na ziemie zachodnie Polski Komendy Okręgu Lwów AK - NIE, podporządkowany ewakuowanej Komendzie Obszaru Lwowskiego. Po aresztowaniu ppłk. Anatola Sawickiego działalność okręgu trwała do 1956r, kiedy to 16 kwietnia podjęto decyzję w nawiązaniu do zarządzenie dowództwa Polskich Sił Zbrojnych na Zachodzie o rozwiązaniu organizacji i zakończeniu działalności. W wyniku zakończenia działalności ujawnili się tylko żołnierze działający pod zmienionymi nazwiskami, a chcący powrócić do swoich prawdziwych.
Na Dolnym Śląsku nie udało się zorganizować siatki wywodzącej się z żołnierzy Okręgu Stanisławów, natomiast oficerowie Okręgów Jelenia Góra Zachód oraz Eksterytorialnych Lwów i Tarnopol utrzymywali od wiosny 1946r. kontakty, dzięki znajomościom trwającym od pierwszej okupacji sowieckiej i niemieckiej w konspiracjach SZP - ZWZ - AK.
Silne komórki Eksterytorialnych Okręgów Lwów i Tarnopol AK-WiN od wiosny 1946r. działały w dolnośląskich miastach, miasteczkach i wsiach m.in. we Wrocławiu, Jeleniej Górze, Kłodzku, Nysie, Oławie, Trzebnicy, Bielawie, Jaworze, Zgorzelcu, Lubaniu Śląskim, gdzie działalność związana z utrzymaniem kanału przerzutowego do Czechosłowacji skupiła się w wioskach Rudzica, Siekierczyn, Mikułowa i Radzimów k. Sulikowa oraz miasta Sląska jak w Opolu, Bytomiu, Gliwicach, Katowicach, Nowej Białce.
Jesienią 1946r. został rozbity przez UB Eksterytorialny Okręg Tarnopol AK. Nie zidentyfikowane przez agenturę sowiecką komórki oraz podlegli im żołnierze ze względów bezpieczeństwa zawiesiły działalność, stanowiąc od tej pory siły zapasowe Eksterytorialnego Okręgu Lwów AK- WiN.
W 1947r. amnestia spowodowała odpływ ludzi z szeregów podziemia, działalność okręgów podległych płk. Władyce została zamrożona.